Esta é fácil.
Quando você precisa remover todos os seus arquivos, formatar um HD, reinstalar tudo etc, quando possível, procura fazer backup de tudo antes.
Algumas pessoas, têm uma série de sites interessantes dentro dos seus favoritos que não gostariam de perder à toa.
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Mas eu não escrevi este artigo para quem quer fazer isto :p
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O navegador oferece também a possibilidade de guardar os seus favoritos (bookmarks) localmente, no seu HD (ou no seu pendrive… aonde você quiser, enfim).
Siga os passos:
- Clique no menu do Chrome menu, no canto superior direito da janela do aplicativo;
- Selecione Favoritos > Gerenciador de favoritos;
- Na tela do gerenciador, selecione o menu Organizar;
- Se quiser gravar, fazer backup dos seus favoritos – que podem ser usados em outro navegador, inclusive – use a opção exportar;
- Para recuperar um backup feito anteriormente, use a opção importar.

Outra forma…
Embora não seja necessária – e nem recomendada pelo fabricante – há uma outra solução: copiar os arquivos da pasta de configurações do Google Chromium.
No Ubuntu, o arquivo de favoritos é este:
~/.config/chromium/Default/Bookmarks
Os métodos mais seguros, contudo, continuam a ser os dois primeiros, já explicados. Lidar diretamente com o arquivo Bookmarks
, só deve ser feito se você souber, mesmo, o que está fazendo.